가장 흔한 부정맥인 심방세동은 약 1/3에서 증상을 느끼지 못하는 경우도 있지만 증상이 없거나 전형적이지 않아서 심각성을 깨닫지 못하고 치료나 관리를 소홀히 하게되면 사망률을 약 3배까지 높일 수 있다. 이처럼 증상과 무관하게 혈전에 의한 뇌경색의 위험도 5배이상 증가시키는 것으로 알려져서 적절한 예방 조치가 필요하다. 일반적으로 환자들의 개별적인 뇌경색 위험도 평가 결과에 따라서 위험도가 아주 낮은 경우(truly low stroke risk)를 제외하고는 항응고제를 복용할 경우 뇌경색 위험을 60-90% 감소시킬 수 있다. 그러나, 항응고제는 혈전위험을 감소시키는 이득과 함께 출혈의 위험을 증가시키는 위험이 있으므로 다양한 상황들에서 문제가 되곤 한다.

일반적으로 권장되는 표준 용량의 항응고제를 사용하는 것이 출혈의 위험 대비 뇌경색 예방 효과가 가장 큰 것으로 알려져 있으나, 출혈 위험이 높거나 항응고치료제에 금기인 경우에는 혈전 위험을 낮추기 위해서 혈전의 주요 병소인 좌심방이(left atrial appendage)를 기계적으로 막아주어 혈전의 위험을 낮추고 항혈전 약물치료의 강도를 낮출 경우 임상적 이득을 기대할 수 있다. 그 외에도 표준 강도의 항응고 치료에도 불구하고 뇌경색을 경험한 경우, 아스피린과 같은 항혈소판 약제의 병합요법을 통해서 치료의 강도를 높이는 것은 출혈의 위험이 높고 장기간 안정적인 유지가 어려울 뿐만 아니라, 뇌경색 위험을 낮추는 이득도 뚜렷하지 않으므로 대부분의 경우에서 권장하지 않는다.